Fuerscher vun der University of Hiroshima kommen méi no fir d'molekulare Prozesser ze entdecken hannert wéi Iwwerschwemmungen Planzen Sauerstoff entzéien. Dëst wäert hëllefen, méi Iwwerschwemmungs-tolerant Kulturen ze kreéieren. Phys.org Portal.
No der Weltbank sinn Iwwerschwemmungen e weltwäite Risiko, deen d'Liewe an d'Besëtz vu Milliarde vu Leit bedroht. Nach méi Leit riskéieren Honger duerch Iwwerschwemmungen: Waasser kann d'Ernte iwwerschwemmt. Fuerscher sinn elo méi no ze identifizéieren molekulare Prozesserënnerleien wéi Iwwerschwemmungen Planzen Sauerstoff entzu kréien. Dëst wäert hëllefen méi elastesch Kulturen ze kreéieren.
Mat der Hëllef vun meta-Analyse, wat d'Re-Analyse vun Daten aus anere Studien am Allgemengen involvéiert, huet e Team vun der Graduate School of Integrated Life Sciences op der University of Hiroshima verschidde gemeinsam fonnt Genen a verbonne Mechanismen am Reis (Oryza sativa) an Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). D'Wëssenschaftler hunn hir Fuerschungsresultater am Journal publizéiert Life.
"Hypoxie ass en abiotesche Stress fir Planzen, dacks duerch Iwwerschwemmungen verursaacht", sot de Studie Co-Autor Keita Tamura, a bezitt sech op de Mangel u Sauerstoff verursaacht duerch Iwwersaturatioun. "Obwuel vill Fuerschung an der Vergaangenheet gemaach gouf, hu mir geduecht datt et verstoppt ass biologesche Mechanismen kann entdeckt ginn duerch Analyse vu verschidde Studien mat Metaanalyse vun ëffentlech verfügbaren Donnéeën.
D'Team konzentréiert sech op Reis a Waasserkress, well d'Genetik vu béide Spezies virdru extensiv studéiert gouf. Laut Tamura gëtt de Reis och als ee vun de wichtegste Kulturen op der Welt ugesinn, als Haaptdéngscht Liewensmëttel Produit fir méi wéi véier Milliarde Leit, laut dem Advisory Group for International Agricultural Research, sou ze verstoen wéi een ze verhënneren datt eng Planz op reagéiert hypoxia, ass entscheedend.
D'Fuerscher identifizéiert 29 Pairen vun RNA Sequenzéierungsdaten fir Arabidopsis a 26 Pairen fir Reis a béid normalen a Sauerstoffmangelbedingunge vun de verfügbaren Datesätz. Laut Professer Hidemasa Bono, RNA-Sequenzéierung beinhalt d'Entschlësselung vun engem geneteschen Blueprint vun engem Sujet op engem bestëmmte Punkt, dat heescht datt d'Date kënne benotzt ginn fir ze studéieren wéi eng Genen déi Verännerungen verursaacht hunn.
"Duerch d'Analyse vun RNA Sequenzéierungsdaten, hu mir 40 an 19 upreguléiert an downreguléiert Genen a béid Arten identifizéiert," sot Bono. "Ënner hinnen, e puer WRKY Transkriptiounsfaktoren a Cinnamate-4-Hydroxylase, deenen hir Roll an der Äntwert op Hypoxie onbekannt bleift, goufen allgemeng a béid Arabidopsis a Reis upreguléiert."
Laut Bono bedeit dës allgemeng Upreguléierung datt dës molekulare Mechanismen méi aktiv ginn wann et e Mangel u Sauerstoff ass, wat hir spezifesch mechanesch Verantwortung ugeet fir wéi Planzen reagéieren.
Bono an Tamura verglach hir Resultater mat enger ähnlecher Meta-Analyse vun Hypoxie a mënschlechen Zellen a Tissueproben. Si hu festgestallt datt zwee vun den allgemeng aktivéierten Genen an ris an Arabidopsis goufen an hire mënschleche Kollegen ënnerdréckt.
"Eis Meta-Analyse proposéiert verschidde molekulare Mechanismen fir Hypoxie bei Planzen an Déieren," sot Bono. "D'Kandidatgenen, déi an dëser Etude identifizéiert ginn, ginn erwaart Liicht op nei molekulare Mechanismen vun der Planzreaktioun op Hypoxie ze werfen. Schlussendlech plangen mir ee vun de Kandidatengenen mat Genome Redaktiounstechnologie ze manipuléieren fir Iwwerschwemmungstolerant Planzen ze kreéieren.